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Dpn I

簡要描述:

Dpn I公司正在出售的產(chǎn)品:肺癌細胞 ALL1相關(guān)蛋白封閉多肽 博爾納病病毒PCR檢測試劑盒 大鼠腦紅蛋白(NGB)ELISA Kit 谷肽還原(GR)活性比色法檢測試劑盒 普遍海單胞菌 尾側(cè)型同源轉(zhuǎn)錄因子1抗體

更新時間:2024-01-12

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Dpn I

商品屬性:

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

貨號

Dpn I

250U*2

A-Hc2234

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儲運溫度:-20℃保存。
來    源:dpnI質(zhì)粒的重組大腸桿菌
單位定義:在37°C條件下,50μl反應(yīng)體系中,一小時內(nèi)消化 1μg的甲基化的 pBR322 DNA 。
失活條件:80℃熱處理 20 分鐘,可使酶失活。
甲基化影響:能夠切斷腺嘌呤甲基化的 GmATC 序列;不能切斷非甲基化的 GATC序列。 能夠切斷來源于大腸桿菌E.coli (dam+)的 DNA;PCR 產(chǎn)物不受dam甲基化的影響。
酶存儲緩沖液:
10 mM Tris-HCl,300mM NaCl,1mM DTT,0.1mM EDTA,500μg/ml BSA,50% Glycerol,pH 7.4
10×DpnⅠ緩沖液:330mM TrisHAc,10mM Mg(Ac)2,660mM KAC,5mM DTT,pH7.9

QQ截圖20240110094643.jpg


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PCR基本步驟及注意事項?

一、實驗原理

PCR是體外人工選擇性擴增DNA的一種方法,它類似于生物體內(nèi)DNA的復(fù)制。在生物體內(nèi)DNA復(fù)制需要模板、引物、DNA聚合酶、DNA解旋酶、 dNTPs;而體外PCR反應(yīng)同樣需要類似的成分,有模板、引物、PCR Buffer、Taq酶、dNTPs。其中引物是人工設(shè)計的特定序列,實現(xiàn)對特定位置的擴增;PCR Buffer提供一個反應(yīng)的緩沖環(huán)境;反應(yīng)過程同生物體內(nèi)一樣,DNA雙鏈打開,引物結(jié)合模板,延伸形成新鏈。而這些過程在生物體內(nèi)靠DNA解旋酶解鏈,而在體外在通過控制反應(yīng)溫度實現(xiàn)的。如常用94℃變性模板DNA打開雙鏈,在退火溫度處引物結(jié)合到模板上,最后在72℃完成延伸,并反復(fù)重復(fù)此過程即可實現(xiàn)對特定片段DNA的大量擴增。到第三循環(huán)開始才產(chǎn)生出和靶DNA區(qū)段相同的DNA分子,進一步循環(huán)地產(chǎn)生出靶DNA區(qū)段的指數(shù)加倍。

在擴增后期,由于產(chǎn)物積累,使原來呈指數(shù)擴增的反應(yīng)變成平坦的曲線,產(chǎn)物不再隨循環(huán)數(shù)而明顯上升,這稱為平臺效應(yīng)。平臺期(Plateau)會使原先由于錯配而產(chǎn)生的低濃度非特異性產(chǎn)物繼續(xù)大量擴增,達到較高水平。因此,應(yīng)適當調(diào)節(jié)循環(huán)次數(shù),在平臺期前結(jié)束反應(yīng), 減少非特異性產(chǎn)物。到達平臺期(Plateau)所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝。

二、主要的成分

1.模板可以是多種形式,主要包括基因組DNA、質(zhì)粒DNA、攜帶病毒的基因組DNA、PCR產(chǎn)物,cDNA等,但不能為RNA。對于不同類型的模板,其主要不同在于預(yù)變性的時間以及模板的量。一般對于大的基因組DNA預(yù)變性時間10min足夠,質(zhì)粒DNA2min、攜帶病毒的基因組DNA預(yù)變性2min、PCR產(chǎn)物預(yù)變性2min即可。

注意cDNA為單鏈DNA,但仍可做PCR的模板,只不過在第一輪循環(huán)時只有一個引物結(jié)合,合成另一條鏈。從第二輪開始,兩個引物均與特異位點結(jié)合,從而實現(xiàn)了與常規(guī)PCR的接軌。而同作為單鏈的RNA卻不能進行PCR擴增,原因就在于實現(xiàn)PCR反應(yīng)的是DNA聚合酶,只能特意識別DNA鏈。

2.對于模版的量來說,一般25ul體系DNA的質(zhì)量為50—100ng。對于基因組DNA由于其結(jié)構(gòu)比較復(fù)雜,提取的濃度也往往比較大,為防止?jié)舛冗^大對PCR造成影響,故需對提取的DNA進行梯度稀釋。否則濃度過高則可能會引起非特異性擴增。對于質(zhì)粒及PCR產(chǎn)物由于其結(jié)構(gòu)簡單,且提取濃度一般較低,則無需稀釋。

PCR實驗中應(yīng)該注意的問題有哪些?

沒有ct值

檢測結(jié)果遇到?jīng)]有Ct值情況,排查是否有以下問題:

1、循環(huán)數(shù)不夠(一般不超過45循環(huán),不僅背景值提高,定量也不準);

2、PCR程序設(shè)置錯誤,檢測熒光信號的步驟有誤。一般SG法采用72℃延伸時采集,TaqMan法則一般在退火結(jié)束時或延伸時采集信號,另外熒光采集是否選中;

3、引物或探針降解??赏ㄟ^PAGE電泳檢測引物和探針是否降解;

4、模板量可能降解或上樣量不足(不超過500ng,根據(jù)試劑盒說明書即可), 對未知濃度的樣本應(yīng)從系列稀釋樣本的最高濃度做起;如果發(fā)生模板降解,應(yīng)考慮樣本準備中雜質(zhì)的引入及反復(fù)凍融的情況,建議將模板樣本小量分裝儲備,避免反復(fù)凍融;

5、引物探針是否合適(尤其是引物跨越內(nèi)含子,以確保擴增基因組DNA;上下游引物Tm值超過4℃以上也會影響擴增)。

ct值過晚

在相對定量中, Ct值一般控制在15—25之間比較好,如果在絕對定量中, 對低拷貝數(shù)的樣品,Ct值會增大, 但是一般不宜超過40循環(huán), 否則定量不準確。

因此,判斷Ct值出現(xiàn)過晚是否屬于非正常情況, 需要根據(jù)具體實驗設(shè)計和目的進行。

1、擴增效率低。引物之間或者引物和探針的比例不合適, 需要進行優(yōu)化;引物或探針設(shè)計不合理, 需要重新設(shè)計;

2、PCR程序不合適, 改用三步法進行反應(yīng), 或者優(yōu)化退火/延伸溫度, 可以適當降低退火溫度; 退火/延伸時間短(可以在推薦的時間條件下延長10s);

3、MgCl2濃度不合適,增加鎂離子濃度等。PCR各種反應(yīng)成分的降解或加樣量的不足;

4、PCR產(chǎn)物太長。PCR產(chǎn)物設(shè)計超過500bp;

5、模板中存在抑制物。用高純度模板進行PCR檢測或?qū)⒛0暹M行稀釋。

公司正在出售的產(chǎn)品:

耶爾森菌通用染料法熒光定量PCR試劑盒

超敏熱休克蛋白60ELISA試劑盒 HSP-60免費代測試劑

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馬齒莧探針法PCR鑒定試劑盒

蛋白O-巖藻糖基轉(zhuǎn)移2ELISA試劑盒

枝孢霉通用探針法熒光定量PCR試劑盒

禽副粘病毒通用染料法熒光定量RT-PCR試劑盒(暫停)

蛋白磷1調(diào)節(jié)因子亞基18ELISA試劑盒

病毒H5亞型(AIV-H5)核檢測試劑盒

病毒N3亞型(AIV-N3)核檢測試劑盒

電壓依賴性陰離子通道蛋白1ELISA試劑盒

佩氏著色霉染料法熒光定量PCR試劑盒

馬動脈炎病毒(EAV)核檢測試劑盒

動力蛋白軸絲重鏈11ELISA試劑盒

流行性造血器官壞死病毒探針法熒光定量PCR試劑盒

麻風(fēng)桿菌PCR檢測試劑盒

多聚腺苷二磷核糖聚合ELISA試劑盒

捻轉(zhuǎn)毛細線蟲探針法熒光定量PCR試劑盒

禽結(jié)核桿菌PCR檢測試劑盒

二肽2ELISA試劑盒

貓源性成分(Feline)核檢測試劑盒

蠟桿菌探針法熒光定量PCR試劑盒

人鈣激活中性蛋白1(CAPN1)ELISA試劑盒

諾如病毒 GI/GII 型和札如病毒PCR檢測試 劑盒(熒光 PCR 法)

胖大海染料法PCR鑒定試劑盒

人孕酮和adipoQ受體家族成員Ⅶ(PAQR7)檢測試劑盒elisa

瓜蔞染料法PCR鑒定試劑盒

鮰愛德華氏菌探針法熒光定量PCR試劑盒

人蛋白S(Protein S)試劑盒ELISA

豬環(huán)曲病毒PCR檢測試劑盒

馬立克氏病病毒探針法熒光定量PCR試劑盒

T淋巴細胞白血病病毒Ⅰ/II(HTLV-Ⅰ/II)抗體ELISA檢測試劑盒

Dpn I短古柏線蟲探針法熒光定量PCR試劑盒

新城疫病毒中強毒(NDV-W)核檢測試劑盒

人補體1q(C1q)ELISA檢測試劑盒

彭氏變形菌PCR檢測試劑盒

 


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