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組織細(xì)胞microRNA提取試劑盒

簡(jiǎn)要描述:

組織細(xì)胞microRNA提取試劑盒公司正在出售的產(chǎn)品:兔骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白SEC24B封閉多肽 貓嗜衣原體PCR檢測(cè)試劑盒 大鼠神經(jīng)特異性烯醇化(NSE)ELISA試劑盒 檸檬(CA)含量活性比色法檢測(cè)試劑盒 龐蒂亞克亞硫鹽桿菌 17號(hào)染色體開(kāi)放閱讀框78抗體

更新時(shí)間:2024-01-12

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組織細(xì)胞microRNA提取試劑盒

商品屬性:

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

貨號(hào)

組織細(xì)胞microRNA提取試劑盒

25T

A-PJ1078

組織細(xì)胞microRNA提取試劑盒

100T

A-PJ1078

描述:生產(chǎn)的組織細(xì)胞 miRNA 提取試劑盒是目前世界 上提取小 RNA(<200nt)操作步驟重復(fù)性最好、 小 RNA 產(chǎn)率最高的方法。使用該試劑盒提取的小 RNA (Small RNA)中,長(zhǎng)度在 15~200nt 范圍的 RNA 在 95% 以上,基本不含有大 RNA 和 DNA。使用該試劑通過(guò)一步上 柱即可獲得高純度 miRNA,可在 45min 內(nèi)完成小 RNA 的提 取。該試劑盒廣泛適用于動(dòng)物組織、細(xì)胞和多糖多酚含量不 高的植物組織樣本。

儲(chǔ)存:室溫可保存 2 年。

使用防護(hù)建議:miRNA Reagent A 溶液中含有胍鹽,其具有 強(qiáng)烈的腐蝕性,試驗(yàn)時(shí)請(qǐng)務(wù)必佩戴防護(hù)眼鏡、手套、口罩等 防護(hù)措施,如有皮膚接觸請(qǐng)立即用大量清水沖洗,再另行就 醫(yī)。

QQ截圖20240110094643.jpg操作方法: 1. 組織樣本提取 (1) 向 1.5ml EP 管中加入 300μl miRNA Reagent A。植物組 織則再加入 10μl β-巰基乙醇,混合均勻。 (2) 在液氮條件下充分將組織研磨粉碎,將一定的樣品量(見(jiàn) 樣本使用量表)研磨成粉狀的組織加入到上述 300μl miRNA Reagent A 中,立即手腕用力震蕩至組織粉末溶解于裂 解液中。室溫靜置 5min 以充分裂解細(xì)胞。 注意:將組織加入到 miRNA Reagent A 后要迅速將組織震散,否 則易引起組織成團(tuán)狀,不容易裂解。如發(fā)生成團(tuán)狀,務(wù)移液器 將團(tuán)狀組織吹打松散。 (3) 向上述裂解完畢的裂解液中加入 350μl miRNA Reagent B,上下顛倒混合均勻。13,000rpm 離心 5min,吸取 550μl 上清液,轉(zhuǎn)移到新的 1.5ml EP 管中。 (4) 向上述溶液中加入 200μl 無(wú)水乙醇,手腕用力震蕩數(shù)次, 室溫放置 5min。 (5) 13,000rpm 離心 10min,轉(zhuǎn)移 700μl 上清液到新的 1.5ml EP 管中。 (6) 向上述溶液中加入 300μl 異丙醇,手腕用力上下顛倒數(shù) 次。 (7) 分兩次將上述溶液倒入到 miRNA 吸附柱中,13,000rpm 離心 1min,倒掉過(guò)濾液。 (8) 向吸附柱中加入700μl 75%異丙醇洗滌一次,13,000rpm 離心 1min,倒掉過(guò)濾液。 (9) 向吸附柱中加入 500μl 無(wú)水乙醇洗滌一次,13,000rpm 離心 1min,倒掉過(guò)濾液。 (10) 吸附柱 13,000rpm 空離心 2min,去掉殘留的乙醇。 (11) 將吸附柱放入到新 1.5ml EP 管中,室溫放置 2min,使 殘留乙醇揮發(fā)。在吸附柱濾芯上加入 30μl RnaseFree TE Buffer,室溫靜置 2min,13,000rpm 離心 2min,洗脫產(chǎn)物 即為提取的 miRNA。(通常取 1~2μl 該產(chǎn)物,即可使用 一步法 miRNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),

2. 細(xì)胞樣本提取 (1) 貼壁細(xì)胞:消化細(xì)胞后,離心收集細(xì)胞沉淀。用 100μl 1×PBS 重懸細(xì)胞后,加入 300μl miRNA Reagent A 顛倒混 合均勻,室溫放置 5min。 (2) 懸浮細(xì)胞:直接離心后,收集細(xì)胞沉淀。用 100μl 1×PBS 重懸細(xì)胞后,加入 300μl miRNA Reagent A 顛倒混合均勻, 室溫放置 5min。 (3) 向上述裂解完畢的裂解液中加入 250μl miRNA Reagent B,上下顛倒混合均勻。13,000rpm 離心 5min,吸取 550μl 上清液,轉(zhuǎn)移到新的 1.5ml EP 管中。 注意:加入細(xì)胞體積數(shù)與 miRNA Reagent B 總體積數(shù)為 350μl。如加入 50μl細(xì)胞,則 miRNA Reagent B使用 300μl。 (4) 向上述 550μl 上清溶液中加入 200μl 無(wú)水乙醇,手腕用 力震蕩數(shù)次,室溫放置 5min。 (5) 13,000rpm 離心 10min,轉(zhuǎn)移 700μl 上清液到新的 1.5ml EP 管中。 (6) 向上述溶液中加入 300μl 異丙醇,手腕用力上下顛倒數(shù) 次。 (7) 分兩次將上述溶液倒入到 miRNA 吸附柱中,13,000rpm 離心 1min,倒掉過(guò)濾液。 (8) 向吸附柱中加入700μl 75%異丙醇洗滌一次,13,000rpm 離心 1min,倒掉過(guò)濾液。 (9) 向吸附柱中加入 500μl 無(wú)水乙醇洗滌一次,13,000rpm 離心 1min,倒掉過(guò)濾液。 (10) 吸附柱 13,000rpm 空離心 2min,去掉殘留的乙醇。 (11) 將吸附柱放入到新 1.5ml EP 管中,室溫放置 2min,使 殘留乙醇揮發(fā)。在吸附柱濾芯上加入 30μl RnaseFree TE Buffer,室溫靜置 2min,13,000rpm 離心 2min,洗脫產(chǎn)物 即為提取的 miRNA。(通常取 1~2μl 該產(chǎn)物,即可使用 一步法 miRNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),。

常見(jiàn)問(wèn)題匯總: (1) 本方法提取的小 RNA,95%以上為小 RNA(200nt 的 RNA,通常殘留的>200nt RNA 不影響后續(xù)試驗(yàn)操作。 (2) 本試劑盒提取的小 RNA 由于不含 mRNA 等大分子量的 RNA,因此更適合做后續(xù)反轉(zhuǎn)錄試驗(yàn),從而進(jìn)行定量試驗(yàn)。 (3) 使用本試劑盒提取的 miRNA 濃度通常在 50ng/μl 左右, 取 5~10μl 即可用于電泳檢測(cè)。取 1~2μl 即可用于 HG TaqMan miRNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)



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PCR基本步驟及注意事項(xiàng)?

一、實(shí)驗(yàn)原理

PCR是體外人工選擇性擴(kuò)增DNA的一種方法,它類似于生物體內(nèi)DNA的復(fù)制。在生物體內(nèi)DNA復(fù)制需要模板、引物、DNA聚合酶、DNA解旋酶、 dNTPs;而體外PCR反應(yīng)同樣需要類似的成分,有模板、引物、PCR Buffer、Taq酶、dNTPs。其中引物是人工設(shè)計(jì)的特定序列,實(shí)現(xiàn)對(duì)特定位置的擴(kuò)增;PCR Buffer提供一個(gè)反應(yīng)的緩沖環(huán)境;反應(yīng)過(guò)程同生物體內(nèi)一樣,DNA雙鏈打開(kāi),引物結(jié)合模板,延伸形成新鏈。而這些過(guò)程在生物體內(nèi)靠DNA解旋酶解鏈,而在體外在通過(guò)控制反應(yīng)溫度實(shí)現(xiàn)的。如常用94℃變性模板DNA打開(kāi)雙鏈,在退火溫度處引物結(jié)合到模板上,最后在72℃完成延伸,并反復(fù)重復(fù)此過(guò)程即可實(shí)現(xiàn)對(duì)特定片段DNA的大量擴(kuò)增。到第三循環(huán)開(kāi)始才產(chǎn)生出和靶DNA區(qū)段相同的DNA分子,進(jìn)一步循環(huán)地產(chǎn)生出靶DNA區(qū)段的指數(shù)加倍。

在擴(kuò)增后期,由于產(chǎn)物積累,使原來(lái)呈指數(shù)擴(kuò)增的反應(yīng)變成平坦的曲線,產(chǎn)物不再隨循環(huán)數(shù)而明顯上升,這稱為平臺(tái)效應(yīng)。平臺(tái)期(Plateau)會(huì)使原先由于錯(cuò)配而產(chǎn)生的低濃度非特異性產(chǎn)物繼續(xù)大量擴(kuò)增,達(dá)到較高水平。因此,應(yīng)適當(dāng)調(diào)節(jié)循環(huán)次數(shù),在平臺(tái)期前結(jié)束反應(yīng), 減少非特異性產(chǎn)物。到達(dá)平臺(tái)期(Plateau)所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝。

二、主要的成分

1.模板可以是多種形式,主要包括基因組DNA、質(zhì)粒DNA、攜帶病毒的基因組DNA、PCR產(chǎn)物,cDNA等,但不能為RNA。對(duì)于不同類型的模板,其主要不同在于預(yù)變性的時(shí)間以及模板的量。一般對(duì)于大的基因組DNA預(yù)變性時(shí)間10min足夠,質(zhì)粒DNA2min、攜帶病毒的基因組DNA預(yù)變性2min、PCR產(chǎn)物預(yù)變性2min即可。

注意cDNA為單鏈DNA,但仍可做PCR的模板,只不過(guò)在第一輪循環(huán)時(shí)只有一個(gè)引物結(jié)合,合成另一條鏈。從第二輪開(kāi)始,兩個(gè)引物均與特異位點(diǎn)結(jié)合,從而實(shí)現(xiàn)了與常規(guī)PCR的接軌。而同作為單鏈的RNA卻不能進(jìn)行PCR擴(kuò)增,原因就在于實(shí)現(xiàn)PCR反應(yīng)的是DNA聚合酶,只能特意識(shí)別DNA鏈。

2.對(duì)于模版的量來(lái)說(shuō),一般25ul體系DNA的質(zhì)量為50—100ng。對(duì)于基因組DNA由于其結(jié)構(gòu)比較復(fù)雜,提取的濃度也往往比較大,為防止?jié)舛冗^(guò)大對(duì)PCR造成影響,故需對(duì)提取的DNA進(jìn)行梯度稀釋。否則濃度過(guò)高則可能會(huì)引起非特異性擴(kuò)增。對(duì)于質(zhì)粒及PCR產(chǎn)物由于其結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,且提取濃度一般較低,則無(wú)需稀釋。

PCR實(shí)驗(yàn)中應(yīng)該注意的問(wèn)題有哪些?

沒(méi)有ct值

檢測(cè)結(jié)果遇到?jīng)]有Ct值情況,排查是否有以下問(wèn)題:

1、循環(huán)數(shù)不夠(一般不超過(guò)45循環(huán),不僅背景值提高,定量也不準(zhǔn));

2、PCR程序設(shè)置錯(cuò)誤,檢測(cè)熒光信號(hào)的步驟有誤。一般SG法采用72℃延伸時(shí)采集,TaqMan法則一般在退火結(jié)束時(shí)或延伸時(shí)采集信號(hào),另外熒光采集是否選中;

3、引物或探針降解??赏ㄟ^(guò)PAGE電泳檢測(cè)引物和探針是否降解;

4、模板量可能降解或上樣量不足(不超過(guò)500ng,根據(jù)試劑盒說(shuō)明書(shū)即可), 對(duì)未知濃度的樣本應(yīng)從系列稀釋樣本的最高濃度做起;如果發(fā)生模板降解,應(yīng)考慮樣本準(zhǔn)備中雜質(zhì)的引入及反復(fù)凍融的情況,建議將模板樣本小量分裝儲(chǔ)備,避免反復(fù)凍融;

5、引物探針是否合適(尤其是引物跨越內(nèi)含子,以確保擴(kuò)增基因組DNA;上下游引物Tm值超過(guò)4℃以上也會(huì)影響擴(kuò)增)。

ct值過(guò)晚

在相對(duì)定量中, Ct值一般控制在15—25之間比較好,如果在絕對(duì)定量中, 對(duì)低拷貝數(shù)的樣品,Ct值會(huì)增大, 但是一般不宜超過(guò)40循環(huán), 否則定量不準(zhǔn)確。

因此,判斷Ct值出現(xiàn)過(guò)晚是否屬于非正常情況, 需要根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和目的進(jìn)行。

1、擴(kuò)增效率低。引物之間或者引物和探針的比例不合適, 需要進(jìn)行優(yōu)化;引物或探針設(shè)計(jì)不合理, 需要重新設(shè)計(jì);

2、PCR程序不合適, 改用三步法進(jìn)行反應(yīng), 或者優(yōu)化退火/延伸溫度, 可以適當(dāng)降低退火溫度; 退火/延伸時(shí)間短(可以在推薦的時(shí)間條件下延長(zhǎng)10s);

3、MgCl2濃度不合適,增加鎂離子濃度等。PCR各種反應(yīng)成分的降解或加樣量的不足;

4、PCR產(chǎn)物太長(zhǎng)。PCR產(chǎn)物設(shè)計(jì)超過(guò)500bp;

5、模板中存在抑制物。用高純度模板進(jìn)行PCR檢測(cè)或?qū)⒛0暹M(jìn)行稀釋。

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