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更新時間:2024-01-14
公司產品僅供科研研究使用、不得用于臨床診斷!
貨號 | 產品名稱 | 規(guī)格 |
A-PJ1121 | Dnase I(Rnase free) | 1000U |
該酶是將單鏈或雙鏈 DNA 同等程度的隨機分解,生成具有 5′-P 末端寡核苷酸的脫氧核糖核酸內切酶。由于RNase-free DNase I 中 Protease 已幾乎被去除,從而提高了該酶在 pH 中性區(qū)域的穩(wěn)定性。此外該酶中添加了
Rnase Inhibitor,用于抑制 RNA 樣品中殘留的 RNase 核酸酶,因此可以有效抑制 RNA 提取過程中 Rnase 酶對 RNA的降解。Stop Buffer 終止反應后,可通過一步加熱失活DNase I 活性。
活性定義
在 50 μl 體系下,37℃ 10min 條件下消化 1 μg pBR322質粒 DNA 所需的酶量定義為 1 個活性單位。純度
2 U 的本酶和 1 μg 的 16S, 23S rRNA 在 37℃、pH7.5 的條件下反應 1 小時,RNA 的電泳譜帶不發(fā)生變化
應用:去除 RNA 樣品中的 DNA 污染。
儲存:-20°C 可保存 2 年。
操作方法(去除 RNA 中的基因組 DNA 污染)
1. 按以下組分配制反應體系
RNA 1~50 μg
10× RD Buffer 2 μl
Rnase Free DNase I (2 U/μl) 1 μl*
Rnase Free H2O Up to 20 μl
*若 RNA 樣品中含有超過 5 μg 基因組 DNA 污染,請使用2 μl 該酶。
2. 37°C 孵育 15min 以消化去除基因組 DNA。
3. 孵育完畢后加入 2 μl 10× RD Stop Buffer,混合均勻室溫放置 1min,并置于 75°C 10min 加熱失活 DNase I。樣品可直接用于下一步反轉錄等試驗。
注意:
1)通常加熱方法即可失活 DNase I。如需要去除殘留的變性蛋白,可在 37°C 消化完畢后使用酚氯仿抽提并沉淀 RNA樣品(不進行加熱操作)。
2)10× RD Stop Buffer 中含有螯合劑用于去除二價陽離子,進行加熱失活前,必須加入 2 μl 10× RD Stop Buffer 并混合均勻,再進行熱失活,否則會導致 RNA 降解。
3)處理完畢的 RNA 樣品進行一步反轉錄反應時,添加量需要<20%(如 20 μl 的反轉錄體系中加入量要<4 μl)
PCR 反應需要使用哪些試劑和設備?
試劑:
模板DNA:PCR反應需要模板DNA,如從細胞、組織、血液中提取DNA等;引物:PCR反應的兩個引物,分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區(qū)域,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;dNTPs:PCR反應中需要四種dNTPs,包括脫氧腺苷酸(dATP)、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP)、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),用于細胞分裂、DNA合成等生物學過程,用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增;Taq DNA聚合酶:PCR反應需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等,用于擴增DNA鏈;PCR buffer溶液:對PCR反應具有緩沖作用,調節(jié)反應pH,硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛,可增強PCR反應特異性,從而提高反應效率;酶切體系:PCR擴增往往涉及到重組、構建和測序等等實驗步驟,常常需要進行酶切操作。MARK:一種分子量標準,用來判別DNA片段大小的工具。DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應產物;
設備:
PCR儀:用于控制反應溫度,保證PCR反應時不同溫度環(huán)節(jié)的嚴格控制;電泳槽:用于分離PCR擴增產物;核酸提取儀:從組織樣本中全自動提取核酸。 這些試劑和設備在PCR分子生物學技術中均是,只有在有序齊全的基礎上,才能進行PCR反應并得出準確結果。
PCR相關基礎實驗:
PCR反應基本步驟一般的聚合酶鏈式反應由20到35個循環(huán)組成,每個循環(huán)包括以下3個步驟:
一、變性:
利用高溫(93-98℃)使雙鏈DNA分離。高溫將連接兩條DNA鏈的氫鍵打斷。在第一個循環(huán)之前,通常加熱長一些時間以確保模板和引物分離,僅以單鏈形式存在。該步驟時間1-2分鐘,接下來PCR儀就控制溫度進入循環(huán)階段。
二、退火或稱接合,復性:
在DNA雙鏈分離后,降低溫度使得引物可以結合于單鏈DNA上。此階段的溫度通常低于引物熔點5℃。錯誤的退火溫度可能導致引物不與模板結合或者錯誤地結合。該步驟時間1-2分鐘。
三、延伸:
DNA聚合酶由降溫時結合上的引物開始沿著DNA鏈合成互補鏈。此階段的溫度依賴于DNA聚合酶。該步驟時間依賴于聚合酶以及需要合成的DNA片段長度。傳統(tǒng)的Taq估計合成1000bp/min、較新的Tbr(來自于嗜熱菌Thermus brockianus)約40秒、商業(yè)公司生產的融合型聚合酶僅需約10-15秒。
PCR反應條件優(yōu)化:
1、變性溫度和時間:
保證模板DNA解鏈是保證整個PCR擴增成功的關鍵。加熱90~95°C, 30~60s,再復雜的DNA 分子也可變性為單鏈。溫度過高或高溫持續(xù)時間過長,可對Taq酶活性和dNTP分子造成損害。
2、復性溫度和時間:
PCR擴增特異性取決于復性過程中引物與模板的結合。復性溫度越高,產物特異性越高。復性溫度越低,產物特異性越低。需根據引物的Tm值具體設定。
3、延伸溫度和時間:
一般位于Taq酶最適作用溫度70~75°C之間。引物小于16個核苷酸時,過高的延伸溫度不利于引物與模板的結合,可以緩慢升溫到70~75°C。延伸反應時間,可根據待擴增片段的長度而定,小于1kb, 1min足夠;大于1kb需加長延伸時間。Taq酶可根據1kb/min增加時間。這里需要注意,延伸時間過長可能出現非特異擴增。因此需要設置恰到好處的延伸時間。
4、循環(huán)數:
其他參數選定后,PCR循環(huán)次數主要取決于模板DNA的濃度。理論上說20?25次循環(huán)后,PCR產物的積累即可達到最大值,實際操作中由于每步反應的產率不可能達到100%,因此不管模板濃度是多少,20~30次是比較合理的循環(huán)次數。循環(huán)次數越多,非特異擴增增加。
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